No$gbaでセーブデータ形式を自動認識して起動してくれる
「NO$Launcher」が2chの裏技・改造板で公開されました。

• 「NO$Launcher.exe」「NO$Launcher.ini」「NL.dat」を
  No$gbaと同じフォルダにコピーして「NO$Launcher.exe」を起動。
  

• 個々に「Load Rom」→「タイトル入力」→「セーブタイプ選択」→
  「save」をすれば次回から設定する必要はありません。
  「Run NO$GBA」でゲームが起動します。

現時点で、Nds2xGL起動はできませんが
昨日紹介した物よりも、非常に簡単で便利だと思います。
関連サイト:「セーブデータ形式一覧」